Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKLN1Q9UL63 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms