Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNL1Q9UK58 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNL1Q9UK58 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms