Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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