Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYTH4Q9UIA0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms