Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LAMTOR3Q9UHA4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms