Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms