Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms