Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms