Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms