Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms