Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEPPQ9NTK1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms