Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBP3Q9NS15 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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