Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms