Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms