Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms