Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM43Q9BTV4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms