Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms