Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms