Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERAC1Q96JX3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms