Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPNQ96H22 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms