Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms