Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms