Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms