Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM71DQ8N9W8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM71DQ8N9W8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms