Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms