Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms