Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms