Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF8Q5VWM4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms