Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHYHD1Q5SRE7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms