Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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