Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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