Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABEP1Q15276 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABEP1Q15276 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms