Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EEA1Q15075 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
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