Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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