Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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