Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAPSNQ13702 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms