Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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