Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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