Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1AQ13111 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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