Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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