Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2AQ12879 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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