Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCAPQ12770 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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