Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms