Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL16A1Q07092 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms