Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX1Q04741 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms