Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAV1Q03135 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms