Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VLDLRP98155 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms