Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms