Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA6P60900 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms