Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXYD4P59646 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXYD4P59646 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXYD4P59646 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FXYD4P59646 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXYD4P59646 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms